Трихомонады являются самым частым представителем группы простейших, вызывающих воспаление гениталий. Размер их составляет 5-30 мкм, форма округлая, овальная, грушевидная или (при больших размерах) полигональная. Ядро вытянутой формы, с заостренными краями, реже округлое, слабобазофильное, гомогенной окраски. Цитоплазма при окраске по Романовскому гомогенная, иногда вакуолизированная, кружевная, слабобазофильная, по Папаниколау -светло-зеленая, интенсивно окрашенная по периферии.
Трихомонады способны вызывать выраженную воспалительную реакцию с некрозом тканей, часто с появлением истинных эрозий шейки матки, последующей эктопией и плоскоклеточной метаплазией. При трнхомонадном кольпите в клетках эпителия бывают выражены дегенеративные изменения с утратой клеточных границ, ядра бледные, слегка увеличенные, нередко обнаруживают околоядерное просветление (гало). Может отмечаться воспалительная атипия. Трихомонады часто сочетаются с другой флорой: кокками, лептотрикс, гарднереллами.
Амебы (Entamoeba histolytica. Entamoeba gingivalis). Поражение гениталий амебами встречается редко, обычно в регионах, где распространены амебные колиты. Иногда их обнаруживают у женщин, пользующихся внутриматочными спиралями. Амебы могут сочетаться с другой флорой: грибами, актиномипетами.
В окрашенных мазках амебы выглядят как округлые или овальные структуры разного размера, в среднем 15-20 мкм, могут встречаться формы до 60 мкм. Ядра округлые, мелкие, располагаются эксцентрически, содержат кариосому. Цитоплазма сероватая или базофильная при окрашивании по Паппенгейму и Лейшману. В цитоплазме обычно содержатся вакуоли без четких границ, пустые бесцветные или содержащие эритроциты, их фрагменты. Может определяться более светлый ободок эктоплазмы.